הטבות המס לעצמאים בקרן השתלמות מורכבות משני חלקים: הטבת "ניכוי" (הכרה בהוצאה) והטבת פטור ממס רווחי הון. כדי ליהנות מהטבת הניכוי המקסימלית, ניתן להפקיד 4.5% מההכנסה הקובעת השנתית, עד תקרת הכנסה של כ-293,397 ש"ח (נכון ל-2024). בנפרד, כדי ליהנות מפטור מלא על מס רווחי הון, תקרת ההפקדה השנתית עומדת על כ-19,920 ש"ח (נכון ל-2024).
